В индекс Яндекса попадают RSS ленты пользователей. Как от этого правильно избавиться?

Ошибка, если посмотреть есть ли страничка в индексе
Но версия DLE у меня старая, сомневаюсь, что дело в версии

У меня почему-то Bing вообще не индексирует сайт после добавления в Вебмастер

Забыл написать что обновился до последней версии 17.3
Интересно узнать, это только у меня проблема, или это проблема движка? проверьте свои сайты на наличие в поиске Bing.
В 11 винде именно эта поисковая система стоит по умолчанию . кроме того эта же поисковая система отвечает за индекс еще одного поисковика - yahoo. Эти системы могут давать дополнительный процент пискового трафика на сайты.

все верно. related_ids автоматом заполняется потом.

в правилах транслитерации для tagvalue поставьте замену " " => "-", например так
str_replace(array('.', ' ', '/', '&', "'", '+', '«', '»', ':', '!'), array('', '-', '-', 'and', '', '', '', '', '', '')

если в доп поле есть пробел, будет выдавать просто 403 стр

Нужно правило с year поднять выше всех в .htaccess

У вас убрано слишком много отличительных признаков в ссылках и теперь ссылки пересекаются. Убрали xfsearch, убрали html, а так же зачем то убрали дефиз разделяющий id и alt_name. Теперь некоторые ссылки будут отвечать выражению под правила ссылок новостей. Исправить вы можете только переосмыслив эти ссылки и добавить в них каких-то отличительных особенностей, переосмыслить чпу.