Как убрать наложение css?

В вашем случае лучше сделать дизайн под разные расширение экрана ,это что то вроде
@media (max-width: 1200px)
@media (min-width: 1200px) и т.д
В инете куча информации.
Попробуйте прописать в стилях
@media (min-width: 1200px) {#wrapper {width: 1000px; }}
и увидите результат