Как задать шаблон вывода для перекрестных доп.полей?

В engine/modules/show.short.php найти

else $tpl->load_template( 'shortstory.tpl' );

заменить на

elseif ($do == 'xfsearch')$tpl->load_template( 'xfsearch.tpl' );
    else $tpl->load_template( 'shortstory.tpl' );

для странниц перекрестных ссылок создаете шаблон xfsearch.tpl

В engine/modules/show.short.php найти

else $tpl->load_template( 'shortstory.tpl' );

выше вставить

elseif(file_exists(TEMPLATE_DIR.'/shortstory/'.$dle_module.'.tpl')) $tpl->load_template( 'shortstory/'.$dle_module.'.tpl' );

в шаблоне создаете папку shortstory в ней создаете шаблоны .tpl с названиями нужных вам странниц коротких новостей.
main - на главной странице
date - при просмотре новостей за определенные даты
cat - при просмотре категории
favorites - при просмотре закладок
newposts - при просмотре новых публикаций (с момента последнего посещения
lastnews - при просмотре последних новостей на сайте
catalog - при просмотре страниц каталога
tags - при просмотре новостей из облака тегов
xfsearch - при просмотре новостей из перекрестных ссылок
allnews - при просмотре всех новостей на сайте или всех новостей какого либо пользователя
В вашем случае создаете все тот же шаблон xfsearch.tpl

Если не ошибаюсь, автор данной реализации Sander