Дублируются новости (предположительно) после обновления, куда копать?

Сайт:
- более 7600 новостей в общем
- на главной только три категории (на главной размещается примерно 5900 новостей от общего количества)

Ситуация: обновлялся с 15.3 до 16.1. На начальных страницах главной все в порядке, но на 380+ странице несколько новостей повторяется. Повторы идут несколько страниц, потом прекращаются. Возможно, не связано с обновлением, но проблема была обнаружена именно после обновления. ID новостей одинаковые (т.е. это НЕ дубли в бд). При этом, если открыть категорию или выводить через custom - все хорошо, т.е. проблема именно на главной (ну либо просто не нашел, хотя искал специально).
На сайте присутствует 2000+ новостей с датой публикации, совпадающей секунда в секунду. Повторы наблюдаются именно в этих новостях (сами повторяющиеся новости в количестве -+10шт от этих 2000)

Что делал:
- Чистил кэш сайта (через админку и очищал папку cache)
- Чистил dle_post_exras
- Пробовал подключать базу данных к абсолютно чистому свежеустановленному движку
- Менял шаблон
- Использовал встроенные средства DLE для ремонта бд
- Делал перестроение

Буду рад любому совету и предположению в какую сторону копать. Описал, возможно, коряво, но, надеюсь, более-менее понятно.